Возьмем две категории 

 и 

 и некоторый класс функторов вида 

, который мы обозначим 

. Естественно было бы назвать преобразованием функторов функцию 

.
Мы хотим организовать функторы 

 в категорию. Объекты уже есть: это функторы 

. Теперь надо придумать стрелки. То есть для каждой пары функторов -- множество стрелок между ними, а также композицию стрелок.
А вы хотите взять какой-то подкласс класса объектов и каждый объект оттуда куда-то послать. Это что-то не то. Если бы вы говорили про группы, то ваша фраза звучала бы так:
Возьмём некоторый класс групп  . Естественно было бы назвать гомоморфизмом в категории групп функцию
. Естественно было бы назвать гомоморфизмом в категории групп функцию  ...
...
Дальше не комментирую, потому что сначала тут бы разобраться (дальше тоже странное написано).
А чтобы разобраться, советую внимательно подумать про пример с определителем. А именно, возьмём два функтора из категории полей в категорию групп: один 

, который полю 

 сопоставляет группу 

 невырожденных 

 матриц с элементами из 

 (а как он действует на гомоморфизмах полей, сообразите сами); другой 

, который полю 

 сопоставляет мультипликативную группу 

 этого поля (а как он действует на гомоморфизмах полей, сообразите сами). Докажите, что определитель 

 задаёт естественное преобразование 

.
Обратите в частности внимание, что если мы знаем гомоморфизм полей 

 и умеем считать определитель любой матрицы из 

, то у нас имеется совершенно естественный кандидат на роль определителя 
соответствующей матрицы из 

...