А как Вы определяете размер атома водорода?
В Ландау-Лифшице подробно расписано.
А размер волнового пакета центра инерции не причем?
Н
и при чём. Не "не". P. S. Хотя да, при чём, см. следующий абзац.
Я это к тому, что если поместить атом водорода в ящик маленьких размеров (несколько атомных расстояний), то спектр атома сильно поменяется.
Угу. В общем, если не упоминать доплеровского уширения линий, классический расчёт спектра относится к атому, чей центр инерции образует волновой пакет - собственное состояние при

Думаю, вы знаете, что это за волновой пакет.
Какой бы густой ни был спектр (пусть он непрерывен), он не будет излучать и поглощать бесконечную энергию, так как населенности определяются температурой и сильно (экспоненциально) подавлены, по Бозе-Эйнштейну ли, по Больцману ли, все равно.
Это в общем верно. Но если населённости в одном месте подавлены, то в другом, наоборот, велики. И если спектр из-за населённостей мало что может излучать, то наоборот, много может поглощать.

- не такая температура, чтобы падающими фотонами пренебрегать. Есть эксперименты с созданием Бозе-конденсата атомов, но там температуры существенно другие (чтобы этот конденсат существовал заметное для экспериментаторов время). Ну и, сам конденсат тоже выглядит совсем не как "кристалл микронных размеров".