Коронавирус

[mustitz]

ET в сообщении #1441632 писал(а):

А есть ли хорошая гарантия, что те коронавирусы, эпидемия которых разрастается в Южной Корее, Иране и Италии это именно тот, уханьский?

Вирус эволюционирует, так что 100% не уханьский. Подробнее можно найти, например, на элементах в статье Протокол эпидемии: что может сказать биоинформатика о вспышке nCoV. Там уже целое дерево нарисовалось. А вот насколько существенны этиразличия сказать сложно.

[ET]

Dmitriy40
Я же писал в начале всплеска (того самого, когда ЮК полезла вверх), а не первые заражения
Вот, нашел статью:
https://www.gazeta.ru/social/news/2020/ ... 0645.shtml
И по-моему видел более общую о том, что у этого всплеска у оченьм ногих не выявлено источника заражения

[EUgeneUS]

ET в сообщении #1441632 писал(а):

А есть ли хорошая гарантия, что те коронавирусы, эпидемия которых разрастается в Южной Корее, Иране и Италии это именно тот, уханьский?

Есть. Тест системы называются. В тест системах - ПЦР на РНК данного вируса.
Можно, конечно, сделать, как сделали на Украине где-то в начале эпидемии - взять тест систему на старый человеческий корона вирус, объявить, что выявлен зараженный. А потом долго и нудно объяснять, что "это не то коронавирус". Но это отдельный анекдотичный случай.

Dmitriy40 в сообщении #1441640 писал(а):

Проводить ген.тесты всех заразившихся никто не будет, кажется медицина ещё не доросла до столь тотальных анализов, и судят по внешним проявлениям (не только у самого больного, но и высеянной культуры вируса, а может и под микроскопом смотрят, не знаю).

Именно, что проводят всем, или почти всем. В Китае в очаге, ставили диагноз по клиническим проявлениям, с чем была связана корректировка статистики. Но человека не будут считать вылеченным (по китайкой схеме), если как минимум дважды не будет отрицательный тест на вирус.

Dmitriy40 в сообщении #1441640 писал(а):

Подробнее я ответить не могу, извините, из-за недостатка знаний по теме, пусть лучше диванные специалисты расскажут.

Вот и отвечаю. А знания есть в открытом доступе, как раз от специалистов.

ET в сообщении #1441637 писал(а):

И что насчет упомянутых вами "прослеженных путей распространения", если в Южной Корее в начале этого всплеска кричали, что их не нашли?

Не знаю, что там кричали в Южной Корее, но ВОЗ высказывала озабоченность наличием случаев, по которым не отслежены цепочки.
Это может быть связано с тем, что передача была через носителя без симптомов, который не прошел через сито.

-- 26.02.2020, 18:22 --

Традиционная нумерология.

1. В Китае все хорошо:
Кривая смертности (случаи в день) два дня резко идет вниз. Похоже, пик уже пройден.
Вне очага позавчера было 9 случаев. Казалось бы меньше (на спорадических случаях) некуда. Но нет, вчера было 5 случаев на весь Китай, за исключением очага.

2. Вне Китая всё плохо. За сегодня (26.02) в таймлайне на английской вики уже 409 случаев. Есть все шансы, что 26.02 войдет в историю, как первый день, когда количество новых случаев вне Китая стало больше, чем в Китае. Если не 26.02, то всё равно этот переломный момент близок.

3. Фиксируется поток зараженных не из Китая, а в Китай. В Китае был зафиксирован больной, прилетевший в Шанхай из Ирана с пересадкой в Москве. Половина рейса Сеул-Нанкин помещена под карантин, так как у одного из пассажиров была высокая температура.

4. Странно ведет себя российский Роспотребнадзор. Минздрав сообщил, что у трех эвакуированных в Казань обнаружен вирус, однако Роспотребнадзор продолжает утверждать, что новых заболевших нет. Если они собираются считать только заболевших (с симптомами и положительными тестами), то это манипуляция какая-то.

5.

Цитата:

Ситуация с распространением нового коронавируса COVID-19, которая наблюдается в Италии, может вскоре повториться в других европейских странах, заявила на пресс-конференции в Риме директор Европейского центра контроля и профилактики заболеваний (ECDC) Андреа Аммон.

Отсюда Тут добавить нЕчего.

6.

Цитата:

Накануне, 25 февраля, первый заместитель главы Центров по контролю и профилактике заболеваний США (CDC) Энн Шухат предупредила, что развитие ситуации свидетельствует о неизбежности перерастания эпидемии COVID-19 в пандемию.

«Это не вопрос [что будет] «если». Это вопрос того, когда [это произойдет] и сколько людей будет заражено», — сказала Шухат.

Отсюда И тут добавить нЕчего.

7. И вишенка на торте из сегодняшних новостей

Цитата:

Коронавирус не повлиял на планы по хаджу, заявили в Совете муфтиев

[Dmitriy40]

EUgeneUS в сообщении #1441644 писал(а):

Именно, что проводят всем, или почти всем.

Я подразумевал немного другое, не будут проводить полную расшифровку генома вируса каждого заболевшего. Тесты же проверяют не полный геном вируса, а лишь его характерную часть (и это наоборот достоинство теста если кто не понял). Насколько при этом вирус "тот же" вопрос не ко мне.

EUgeneUS в сообщении #1441644 писал(а):

4. Странно ведет себя российский Роспотребнадзор. Минздрав сообщил, что у трех эвакуированных в Казань обнаружен вирус, однако Роспотребнадзор продолжает утверждать, что новых заболевших нет.

Гипотеза: они продолжают их плюсовать в Принцессу, а не в РФ, т.е. разные ведомства различают понятия "россиян" и "в России".

[EUgeneUS]

Dmitriy40 в сообщении #1441647 писал(а):

Я подразумевал немного другое, не будут проводить полную расшифровку генома вируса каждого заболевшего.

Это да, согласен.

Dmitriy40 в сообщении #1441647 писал(а):

Гипотеза: они продолжают их плюсовать в Принцессу, а не в РФ, т.е. разные ведомства различают понятия "россиян" и "в России".

Так до эвакуации они в статистику по "Принцессе" не вошли. Вирус обнаружили уже в РФ.
Американцы (и не только они) плюсуют в свои случаи такое, не стесняются.

-- 26.02.2020, 18:55 --

mustitz в сообщении #1441642 писал(а):

Вирус эволюционирует, так что 100% не уханьский. Подробнее можно найти, например, на элементах в статье Протокол эпидемии: что может сказать биоинформатика о вспышке nCoV
. Там уже целое дерево нарисовалось. А вот насколько существенны этиразличия сказать сложно.

1. Статья хорошая.
2. Насколько понимаю, этого всего недостаточно, чтобы считать, что теперь это другой вирус, "не уханьский".

[Dmitriy40]

ET
Из статьи на элементах довольно прямо сказано что вирус вне Китая это тот же самый вирус (если отдельные штаммы считать таки одним вирусом):

Цитата:

«Перескочив» в людей, вирус продолжил эволюционировать, «прорастив» ветвистое эволюционное древо уже в людях (рис. 2) К сожалению, сегодня известны лишь очень немногие «листья» этого древа. Самые новые последовательности из Уханя датируются 3 января, и 42 из 73 известных сегодня последовательностей получены снаружи Китая

[mustitz]

EUgeneUS в сообщении #1441649 писал(а):

2. Насколько понимаю, этого всего недостаточно, чтобы считать, что теперь это другой вирус, "не уханьский".

Ну... любые два человека имеют различную ДНК. Вопрос видов/штаммов для вирусов вообще, как я понял, очень больная тема. Поэтому этот вопрос стараються аккуратно обходить. Но все рассмотренные случаи происходят из Уханя. А сейчас даже в самом Ухане сейчас есть несколько модификаций.

[NikolayPrimachenko]

(Оффтоп)

Dmitriy40, а вот, кстати, Бол. мед. энц. вым. болезней предупреждает, что демагогома, осложненная перевритом, с трудом поддается лечению и часто переходит в хроническую форму.

mustitz, статью прочитал. Можно, думаю, смотреть, как оно бывает, на примере гриппа. Свиной грипп 2009 года:

Otte et al. в Evolution of 2009 H1N1 influenza viruses during the pandemic correlates with increased viral pathogenicity and transmissibility in the ferret model писал(а):

In the UK, three distinct influenza waves were reported with the third epidemic causing a greater burden of severe illness compared to the previous year. Epidemiological analysis revealed that 2009 pH1N1 IAV must have evolved and increased their fitness in the human host by the end of 2010. This third epidemic in winter 2010/2011 was unexpected given the low susceptibility of the human population after two subsequent infection waves. Thus, it was proposed that increased viral transmissibility was the major contributor to increased viral spread and disease severity observed in humans.
...
Modelling studies revealed that increased transmissibility of 2009 pH1N1 viruses acquired after pandemic onset was the major contributor to severe disease outcome during the third wave in winter 2010/2011 in the UK. HH15-specific sites in NP-100I, HA-202T and NS1-123V were highly prevalent in 2009 pH1N1 strains isolated during the 3rd and most severe wave (2010 to 2011) of the pandemic with increased hospitalizations and deaths compared to the first two waves in the UK.
...
Further studies are required to assess whether a single mutation in HA is sufficient to confer more efficient respiratory droplet transmission or whether the effects are only observed when all HH15-mutations are combined.

Т.е., в принципе, даже одна замена может привести к существенному изменению характера болезни.

-- 27.02.2020, 02:40 --

(Вести из Приморья)

Роспотребнадзор сообщал, что по ОРВИ и гриппу с 10 по 16 февраля эпидпорог в Приморье был превышен на 34,5%. Новее пока на их сайте нет данных.

Роспотребнадзор в сообщении от 26 февраля 2020 г. писал(а):

Во всех пунктах пропуска через государственную границу Приморского края проводится усиленный двойной контроль прибывающих из неблагополучных регионов лиц с использованием стационарного и переносного тепловизионного оборудования.
При прохождении санитарно-карантинного контроля за период с 1 января - 25 февраля 2020 года в пунктах пропуска через государственную границу Российской Федерации, специалистами Управления Роспотребнадзора по Приморскому краю досмотрено 167240 прибывших из-за рубежа человек.
Случаев подозрения на заболевание новой коронавирусной инфекцией в Приморском крае не зарегистрировано.

Люди с Принцессы находятся на карантине в Больнице рыбаков во Владивостоке. На NewsVL.ru были сообщения об этом: тыц и тыц.

[Mental]

Ведомости писал(а):

Вице-премьер Татьяна Голикова объявила, что с 1 марта Россия ограничит авиасообщение с Южной Кореей, а также перестанет выдавать визы гражданам Ирана, за исключением деловых и дипломатических. Аналогичные меры по отношению к Италии не вводятся из-за того, что страна входит в Евросоюз, объяснила вице-премьер. Ранее Роспотребнадзор призвал россиян отказаться от поездок в вышеперечисленные страны.

Т.е. итальянская дверь для короновируса в Россию отрыта?!

[ET]

Mental
Ее сложнее закрыть
Границы внутри прозрачные. На прилетел я в Вену, улетел из Парижу. Все без отметок в паспорте и без лишних виз. А проехал весь север Италии. Всех шенгенских проверять?
Вот если Италия приостановит действие шенгенского соглашения, тогда вероятнее всего и мы другие страны введут. Хотя эту приостановку могут сделать ее соседи.

[Mental]

ET в сообщении #1441795 писал(а):

Ее сложнее закрыть
Границы внутри прозрачные. На прилетел я в Вену, улетел из Парижу. Все без отметок в паспорте и без лишних виз. А проехал весь север Италии. Всех шенгенских проверять?
Вот если Италия приостановит действие шенгенского соглашения, тогда вероятнее всего и мы другие страны введут. Хотя эту приостановку могут сделать ее соседи.

Согласен, что непросто. Но всё равно есть большая разница откуда приехал человек: из очага поражения или места, где случаи заражения вирусом пока не зафиксированы.

[EUgeneUS]

Dmitriy40 в сообщении #1441647 писал(а):

Гипотеза: они продолжают их плюсовать в Принцессу, а не в РФ, т.е. разные ведомства различают понятия "россиян" и "в России".

Вы были правы, что "их продолжают плюсовать в Принцессу". Глава Роспотребнадзора Попова вчера дала разъяснения:

Цитата:

По ее словам, всего на борту лайнера были 24 российских гражданина, из них 21 уже в России. «Хочу вам сказать, что госпитализированы и под медицинским наблюдением находятся в инфекционных стационарах все из них», — уточнила Попова. В Казань доставили восемь россиян — трое, у которых была выявлена инфекция еще в Японии, и члены их семей.

-- 27.02.2020, 19:08 --

Традиционная вечерняя нумерология.

1. Как и ожидалось, 26 февраля вошел в историю, как день, когда количество выявленных заразившихся в Китае стало меньше, чем во всем остальном мире.
$433$ - во всем Китае, $562$ в остальном мире (по данны тайм-лайна в англовики).

2. 27 февраля войдет в историю, как день, когда количество выявленных заразившихся в Китае будет меньше, чем во другой отдельно взятой стране. В Корее уже $505$ за сегодня, крайне мало вероятно, что в Китае превысит $500$

3. В очаге (Хубей) уже четвертый день количество новых случаев близко к $400$, с выбросом до $499$ 24 февраля.

4. В остальном Китае $24$ случая. С учетом, что $10$ случаев - это Пекин, а $5$ случаев в провинции Хэбей, которая охватывает Пекин с трех сторон, похоже выявили какой-то кластерный случай.

5. Количество умерших за день в Китае продолжило падать стремительным домкратом - 29 умерших за день.

6. В остальном мире... Ничего хорошего, к сожалению. Япония, Иран и Кувейт уже сегодня обновили дневные максимумы. Продолжается какая-то сранная история в Гонконге и Сингапуре - случаев в день вроде немного, но каждый день. И уже длительное время.

[Dmitriy40]

В Румынии странный случай:

Цитата:

1st case in Romania: a person who had returned from Italy 3 weeks ago.

Странен тем что пишут про три недели после контакта, который тоже вряд ли бы 0-day случаем (это уже мои догадки), а значит это один из самых длинных зафиксированных инкубационных периодов, больше трёх недель. Если не обнаружится другого пути заражения.

[EUgeneUS]

Dmitriy40

А в каком состоянии он обратился, не пишут?
Может 10-14 дней инкубационный период, 7-10 дней болел без обращения к врачам. А как стало совсем хреново, пришел.

[Dmitriy40]

EUgeneUS в сообщении #1441844 писал(а):

Традиционная вечерняя нумерология.

Добавлю.
7. Италия отказывается от сплошного тестирования и будет проверять лишь с симптомами:

Цитата:

Italy has announced on Feb. 26 that it would begin testing only people with symptoms, claiming that the higher number of cases (compared to other European countries) is due to more tests being conducted.

К сожалению без ссылки на оригинал.
И немного смахивает на манипуляции со статистикой в Китае ранее ради не столь пугающих цифр.

EUgeneUS в сообщении #1441852 писал(а):

А в каком состоянии он обратился, не пишут?

Не пишут, новость очень короткая (и вся её суть передана в цитированном тексте), а официальных документов я не искал.