кажется, она испорчена элементарными частицами, где упругость ударов норма...
Там просто другой механизм возбуждения -- там поглощение если идёт, то дискретными порциями. Или не идёт вообще. Так что никаких аналогий, конечно, быть не может.
Но движение в одном направлении, пока не достигает границы,
Ну так ровно так оно в этой модели и идёт.
Столкновение еще не закончилось, первый брусок все еще прижат ко второму, он оторвется когда волна пройдет через него в обратном направлении.
Когда
левая волна пройдёт в обратном направлении. Ну так она уже давно прошла к моменту встречи левой и правой в середине длинного бруска.