Понятие должно быть определено однозначно.
Нет. Понятие должно быть определено однозначно в рамках одной теории, и одного матаппарата. В разных теориях, которые не применяются одновременно, понятие может быть определено по-разному.
Например, в физике газов вакуум - это одно, а в квантовой теории поля вакуум - это другое. И ничего страшного.
Вы, может быть, привыкли к ГОСТам, но наука - это другое.
Так не бывает.
Бывает.
Но, конечно, может быть, если принять что логика не распространяется на физику
Логика распространяется на физику. Просто логика - штука более сложная, чем думают некоторые наивные дилетанты. В физике логика используется на всю катушку, и поэтому получаются сложные логические соотношения, которые дилетантам могут показаться (показаться!) нарушающими логику.