Описываться они могут как угодно, какими угодно отношениями, иметь в модели какие угодно свойства. Но все эти свойства и отношения с точки зрения понимания мироустройства ничего не стоят, пока не известен механизм реализации описываемых свойств и отношений на физическом уровне.
Опять эти бессмысленные слова. То, что любые объекты описываются свойствами и отношениями между ними - так уж устроен синтаксис нашей логики. Посмотрите в википедии статью про логику первого порядка. Свойство определяется формулой с одной свободной переменой, отношение - формулой с двумя (иногда более) свободными переменными.
Поэтому когда Вы будете описывать какой бы то ни было "механизм", Вам придётся описывать его через свойства и отношения. Не знаю уж, какие описания по Вашему мнению чего-то "стоят", какие являются описаниями "механизмов" или "не механизмов". По моим понятиям описания бывают подходящими к предметной области или не подходящими, остальное не имеет значения.
Вот есть допустим описание коллапса квантовых частиц, когда они разнесены на огромные расстояния, и, казалось бы, никакой обмен информации невозможен. Однако же, он есть, да ещё и намного быстрее скорости света работает. А может вообще мгновенный. Каков механизм этого обмена? Физики просто забили на этот вопрос, как я вижу.
Там и нет обмена информацией. Описание такого уровня трактовать с позиций бытовой интуиции бесполезно.
Проявление - это описание вида "мы сделали это, получили это". Механизм - "мы сделали это, это вызвало на физическом уровне такие процессы - как результат получили это".
Вы просто добавили ненаблюдаемый промежуточный уровень между "мы сделали это" и "мы получили это". Наука тоже часто так делает, но не ради выявления какого-то "механизма", а для получения универсальной (т.е. применимой во многих случаях) теории. Например, между "мы ударили кием по шару" и "шар упал в лузу" находится универсальная теория - Ньютоновская механика, включая раздел об упругих столкновениях двужущихся твёрдых тел, которая применима не только к данному случаю.
Так что теория, получается, и есть тот "механизм", который Вы ищете. Далее вопрос: Чем Вас не устраивают теории фундаментальной физики в качестве таковых "механизмов"?