Munin ошибки ввода-вывода могут привести только к ложно-отрицательному результату (если они приводят к ложно-положительному, то ошибочно введенная схема доказательства - и есть верная

).
Ошибки программирования можно сколь угодно минимизировать массовостью реализаций системы.
Аппаратные ошибки можно сколь угодно минимизировать массовостью перезапусков системы на разном железе.
Остаётся возможность ошибки в самом алгоритме проверки.
Получается, как с простыми числами, можно давать сертификат на доказательство: "проверено ... алгоритмом". В любом случае, ничего более убедительного человек не получит.