В КТП при описании состояния, насколько я слышал делается учет влияния вакуума на исследуемую систему
Скажите могут ли вакуумные колебания взаимодействовать между собой и образовывать некие структуры или системы при этом взаимодействии
И если да то может ли современная КТП эти процессы описывать?
Всё, что говорится про "вакуум" в современной физике - говорится только и исключительно на языке КТП, больше
нечему его описывать. Если, конечно, не говорить про вакуум в техническом смысле, как про откачанный воздух, про газ, разреженный до состояния бесстолкновительности.
Всё, что "возникает" в вакууме, исключительно эфемерно. Ну, скажем, какова вероятность возникновения электрона? Среди некоторых разных множителей, там будет множитель

в который надо подставить

- энергию покоя электрона, а

- комнатная температура (или температура в лабораторной установке, в которой проводится опыт). Энергия покоя электрона, в переводе на градусы Кельвина, равна 6 миллиардов кельвинов - делим на комнатную температуру 300 кельвинов, и получаем 20 миллионов
в показателе экспоненты.
Теперь, чтобы говорить о структурах, надо во-первых образовать все элементы этих структур - с соответствующими вероятностями, и потом ещё совместить их вместе, чтобы они состыковались. В принципе, могут. А на практике - подумайте сами.