Нашел на мой взгляд самое простое объяснение того, почему фаза меняется на

для параллельной составляющей поля после отражения. Правда оно лишь для нормального падения, когда углы падения и преломления равны нулю. Но тем не менее, может кому-то интересно. В случае нормального падения, очевидно, пропадает смысл в разделении на параллельные и перпендикулярные составляющие, ибо отпадает смысл выделять плоскость падения, относительно которой мы и вводили значки

и

. Таким образом, для параллельной и перпендикулярной составляющей формулы должны совпасть.
В случае нормального падения формулы Френеля для амплитуд отраженной волны имеют вид:

Как видно, они отличаются ровно знаком. Но в случае нормального падения перпендикулярные составляющие полностью совпадуд в то время как параллельные будут отличатся направлением. Поэтому мы должны выбрать формулу для

, из которой сразу видно, что в случае

имеем

. Знак "

" можно интерпретировать как

, что добавляется к фазовому множителю у

.