Естественное происхождение шаров снимает и загадку упорядоченного их расположения на поверхности. Расставить согласно задумке уже готовые шары – занятие менее трудное, как если бы их надо было ещё и изготовить.
Археологи признают только искусственное происхождение шаров. По их мнению, шары были изготовлены путём обработки округлых валунов до сферической формы, которое осуществлялось в несколько этапов. Сначала их подвергали попеременному сильному нагреву и охлаждению. Затем обрабатывали каменными инструментами такой же твёрдости. В конце каменные заготовки помещали на специальные подставки и шлифовали до блеска.
Если бы в археологических заведениях изучали геологию, хотя бы динамическую, их выводы были бы другими.
По одной из версий, шары изготавливали скучающие нацистские мигранты, бежавшие в Латинскую Америку после краха «третьего рейха».
По другой версии, майя изготавливали каменные шары по причине своего безделья. Возделывание маиса (кукурузы) - основной сельскохозяйственной культуры индейцев занимает всего несколько дней в году, и у них было много свободного времени: как минимум 90% времени индейцам было нечем занять себя. Отсюда такое обилие монументальных сооружений, требующих много времени, ритуалов и обрядов, хороших знаний в астрономии, медицине и других областях. Но такая версия имеет ограниченное применение. Если майя могли позволить себе такой досуг, то другие народы нет, хотя в местах их былого проживания также обнаружены каменные шары.Этому можно было бы поверить, если бы круглые камни находили только здесь.
Непостижимой загадкой для археологов является и назначение каменных шаров. Существует мнение, что их ставили перед домами знатных особ в качестве символа их неограниченной власти или тайного знания.
В Коста-Рике значительная часть каменных шаров была разбросана группами, образуя прямые и извилистые линии, треугольники и квадраты. Одна группа из четырёх шаров была выровнена по линии, ориентированной на магнитный север. На этом основании Ивар Запп предположил, что древний народ Коста-Рики был хорошо знаком с магнитным компасом и астрономической ориентацией. Однако гипотеза Ивара Заппа, что группы каменных шаров являлись навигационными устройствами, указывающими на остров Пасхи и Стоунхендж, представляется маловероятной, так как линия из четырёх шаров имеет длину только несколько метров, чего недостаточно, чтобы избежать ошибки при наблюдениях. Кроме того, в основном круглые камни встречаются вдали от моря, за исключением тех, что найдены в Исла дель Како или других местах, чтобы быть полезными для навигаторов.
Существует также версия, что расположение некоторых групп копирует небесные созвездия. Из этого факта некоторые исследователи заключили, что шары Коста-Рики являются своеобразной "обсерваторией" или даже ориентирами для звездолётов инопланетян. Несмотря на привлекательность таких версий, следует отметить, что их авторы больше полагались на свои фантазии, нежели на действительные результаты полевых исследований археологов.
Самую большую загадку для исследователей представляют каменные шары с надписями и рисунками, так называемые «шары-послания Коста-Рики». Часть этих шаров специалисты считают естественными образованиями, на которых наши предки «расписались», в других случаях они всерьёз говорят об их искусственном происхождении. В общем, здесь также нет единодушия.
Сегодня большинство групп разрушены, поэтому измерения, выполненные более полувека назад, невозможно проверить на точность. Фактически все каменные шары, оказавшиеся на пути сооружаемых дорог и на возделываемых территориях, были перемещены с первоначальных мест, и поэтому говорить о какой-то смысловой информации возможных групп не приходится. Часть шаров разрушили искатели сокровищ, которые поверили байкам, что они содержат золото.
Помимо "навигационной" и "астрономической" гипотез о назначении каменных шаров выдвигалась ещё "топографическая". По мнению её авторов, они играли роль ориентировочных знаков при топографической съёмке местности либо служили триангуляционными пунктами или же временными границами. Следует полагать, что закладывая свои города, майя проводили топографическую съёмку и разметку территории будущего города. Шарообразная форма была очень удобна для перемещения с места на место таких "знаков".
Из всех гипотез о назначении загадочных шаров самой экзотической является «денежная». На некоторых островах Тихого океана до сих пор пользуются каменными деньгами, которые имеют вид жерновов или шлифовального круга. Конечно, можно допустить, что каменные шары служили майя деньгами. Украсть такое «сокровище» невозможно. Потому, как реализовать такой камень всё равно не удастся, ибо он всем известен. Зато шары можно продать, купить, заложить и, вообще, произвести любые финансовые операции, причём, вовсе не обязательно перемещать их к новому владельцу. Таким образом, эти шары одновременно являлись капиталом, и разменной монетой. К тому же финансовая система, основанная на обращении каменных денег, представляется ещё и надежной. Эта гипотеза к тому же и объясняет, почему шары имеют разный размер: чем больше шар, тем больше его номинальная стоимость.
В общем, от таких назначений каменных шаров