Автор в первом параграфе, где описывает обозначения и термины, пишет: будем говорить, что точка лежит в плоскости. Если все точки прямой лежат в плоскости, то будем говорить, что прямая лежит в плоскости. А в следующих параграфах, пишет: проведём на плоскости прямую.
Не вижу ничего странного. Первый глагол пассивен, второй -- активен; кроме того, "проведём" -- это в данном случае синоним "нарисуем", а "рисовать в" -- нельзя. Чего ж удивляться, что и предлоги разные.
Что поделать. Русский язык -- многовариантен, и стилистика вовсе не всегда совпадает с логикой.