Я не очень понимаю какой физический смысл будет иметь понятие метра, если эталонный метр будет сжиматься в ракетах как гармошка
Как разгонять стержень так, чтобы он сохранял длину в системе наблюдателя на этом стержне - это еще отдельный вопрос. Это же нужно одновременно все его точки начать разгонять с разным постоянным ускорением. Так мы обычно не поступаем. Обычно мы его толкаем с одного конца или тянем за другой. В этом случае на его длину гораздо больше будет влиять скорость звука в стержне, а вовсе не эффекты СТО.
Я полагаю что ось абсцисс по определению проходит через точки в которых показания часов совпадают
Нет. Эта в общем случае искривленная линия одновременности проходит по событиям, одновременным для выбранного наблюдателя. А одновременными для него на этой линии могут оказаться события, часы в которых показывают что угодно. Они вовсе не обязаны показывать одинаковое время. Одновременными может оказаться множество часов, которые показывают разное время. Так в СТО и происходит на каждом шагу.