Либо вымерли путём естественного отбора...
Слово "вымерли", в отличие от "умерли", применимо к большим группам организмов: видам, родам, семействам и так далее.
Поскольку бобры в целом не вымерли, то нельзя говорить, что бобры с мелкими зубами вымерли. Они просто больше не встречаются в популяции (и даже точнее, их частота в популяции снижена). Популяция в целом выжила. Вот если бы вся популяция была с мелкими зубами, то она могла бы вымереть, но тогда бы у нас просто не было бобров. Бобры с мелкими зубами не
вымерли, а
были отсеяны естественным отбором. Современные бобры - в некоторой степени потомки прошлых бобров с мелкими зубами, точно так же, как и бобров с большими зубами (синхронных между собой).
Если палеонтологи находят несколько видов древних бобров, одни с более крупными зубами, другие с более мелкими, и могут сделать вывод, что некоторые из них пресеклись, то они могут пользоваться словом "вымерли". Но на уровне ниже популяции это некорректно.
И даже с разными видами не всегда точно, поскольку виды могут быть изолированы не полностью. Например, неандертальцы, строго говоря, не вымерли, а смешались с сапиенсами.
Совсем на пальцах: ваша пра-пра-прабабушка умерла, но не вымерла.
...либо не появлялись вовсе.
Поскольку бобры - млекопитающие, то у них были предки с мелкими зубами.
Поскольку зайцы - млекопитающие, то у них были предки с небелой шерстью зимой.
Поскольку зебры - непарнокопытные, то у них были предки с неполосатой окраской.
Поскольку слоны - млекопитающие, то у них были предки с небольшими ушами.
Вы просто не поняли вопроса.
И нет гарантии, что каждая мутация, способная сделать своего хозяина наиболее успешным в эволюционном плане, либо уже однажды появилась, либо появится в будущем.
При чём здесь "наиболее успешным"? Такого понятия вообще нет.