Похоже это только для атомов существуют определенные значения.
Часто молекулы изображаются ван-дер-вальсовыми сферами.
Нет, для молекул тоже есть определённые значения. Но смысл у них - условный.
Вот я и подумал (начитавшись там и сям разного), что это радиус на котором одинаковые молекулы начинают отталкиваться между собой.
Похоже неправильно понял.
Молекулы начинают отталкиваться на разных расстояниях, смотря по тому, как они повёрнуты. А ван-дер-ваальсов радиус - это число в некоторой подгоночной формуле - в уравнении состояния неидеального газа. На это число влияют реальные размеры молекул, влияют точные значения сил притяжения и отталкивания, но всё это влияние смешано в кучу. Так что, смысл радиуса это число не имеет ни в каком смысле, кроме условного.
Попробую по другому спросить. Вот две молекулы водорода в нормальных условиях (давление, температура) при столкновении между собой
на каком расстоянии прекратят сближение и начнут отдаляться друг от друга? В среднем имеется ввиду.
Я понимаю, что скорость у них там у всех разная, но если в среднем, то это расстояние снаружи жирной черты (на картинке) будет или внутри?
Это расстояние можно провести не на картинке одной молекулы, а на картинке двух молекул. Эта картинка должна быть как минимум четырёхмерной.