Разве у волновой функции есть физический смысл?
Разумеется. У координат и скорости материальной точки есть физический смысл? Есть. Это её состояние движения. Точно так же, волновая функция - это состояние движения квантовой частицы.
То есть понятно, что фотон (или электрон) точечная частица. Волновая функция и ее плотность вероятностей лишь математически описывают вероятность нахождения данной частицы в какой ни будь точке пространства.
Нет, конечно, не "лишь". Они описывают всю информацию, которую можно в принципе извлечь из Природы, о состоянии этой частицы. Они описывают всю информацию, которую необходимо знать для расчёта, что с ними будет в будущем.
Это "не лишь" выражается в том, что волновая функция содержит не только амплитуду (модуль комплексного значения), но и фазу (аргумент комплексного значения). А плотность вероятностей использует только модуль. Фаза не остаётся "лежать неиспользованной", она важна для вычисления всего остального.
Эта ошибка непростительна для любого студента, изучающего квантовую механику (в полноценном объёме). Если вы читали только популярные книжки, то тоже запомните, что это не так.
Но это же не значит, что эта плотность вероятностей представляет собой физический объект, а именно волну.
Вполне значит. Волна как физический объект - ведёт себя как волна, то есть, отскакивает от препятствий, огибает их, колеблется в резонаторах, интерферирует, переносит энергию и импульс (и таким образом, сама воздействует на другие объекты). Всё это делает волновая функция.
Но повторяю: здесь речь не о плотности вероятности! Речь о волновой функции. Волновая функция "математически более содержательна", чем плотность вероятности: у неё есть фаза.