2014 dxdy logo

Научный форум dxdy

Математика, Физика, Computer Science, Machine Learning, LaTeX, Механика и Техника, Химия,
Биология и Медицина, Экономика и Финансовая Математика, Гуманитарные науки




Начать новую тему Ответить на тему
 
 R cran packages
Сообщение13.02.2013, 20:08 


18/05/12
73
Добрый день

Решил установить R и посмотреть, что он умеет.
Возникла сразу проблема: редкие пакеты устанавливаются без ошибок.

Для примера возьмём пакет Cairo (рус. описание http://r-language.ru/articles/cairo)
Написано: install.packages("Cairo")
У меня происходит загрузка пакета, какие-то проверки, потом большое число вызовов gcc и выход с ошибкой. Приведу конец лога:

(лог)

Код:
xlib-backend.c:34: fatal error: X11/Intrinsic.h: No such file or directory
compilation terminated.
make: *** [xlib-backend.o] Помилка 1
ERROR: compilation failed for package ‘Cairo’
* removing ‘/home/ml/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.11/Cairo’

The downloaded packages are in
    ‘/tmp/RtmpuK9qVo/downloaded_packages’
Warning message:
In install.packages("Cairo") :
  installation of package 'Cairo' had non-zero exit status

 Профиль  
                  
 
 Re: R cran packages
Сообщение13.02.2013, 20:21 
Заслуженный участник
Аватара пользователя


06/10/08
6422
Не стоят заголовочные файлы для xlib, надо поставить пакет, который называется xorg-dev или около того. Наверняка потом надо будет еще ставить -dev пакеты для Gtk2 и cairo.
Какой у Вас дистрибутив Linux? В Debian/Ubuntu есть пакет r-cran-cairodevice, похоже в нем то, что Вам нужно.

 Профиль  
                  
 
 Re: R cran packages
Сообщение13.02.2013, 21:16 


18/05/12
73
Чудно! Этот пакет установился. Делал через установку xorg-dev.

Можете мне подсказать, какие лучше брать пакеты для манипуляций с графами? Я нашёл описание пакета igraph, но он с ним тоже проблемы: пишет, ему требуется gfortran, а он не может быть установлен, потому что сам требует gcc-4.4-base (= 4.4.4-14ubuntu5), а установлен 4.4.4-14ubuntu5.1. Может, есть другие пакеты, которые безпроблемно поставятся + я не знаком с ними вообще, а Вы, может быть, уже сталкивались.

P.S. у меня Ubuntu 10.10

 Профиль  
                  
 
 Re: R cran packages
Сообщение14.02.2013, 13:20 
Заслуженный участник
Аватара пользователя


06/10/08
6422
Я не рабираюсь в R, я просто знаком с репозиторием Debian, поэтому посоветовать по графам не могу. Ситуация с gfortran/4.4.4-14ubuntu5 и gcc-base/4.4.4-14ubuntu5.1 должна решаться обновлением системы. На Вашем месте я бы вообще обновился с неподдерживаемой версии 10.10 на 12.04 LTS или 12.10

 Профиль  
                  
Показать сообщения за:  Поле сортировки  
Начать новую тему Ответить на тему  [ Сообщений: 4 ] 

Модераторы: Karan, Toucan, PAV, maxal, Супермодераторы



Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей


Вы не можете начинать темы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете добавлять вложения

Найти:
Powered by phpBB © 2000, 2002, 2005, 2007 phpBB Group