2014 dxdy logo

Научный форум dxdy

Математика, Физика, Computer Science, Machine Learning, LaTeX, Механика и Техника, Химия,
Биология и Медицина, Экономика и Финансовая Математика, Гуманитарные науки




 
 R cran packages
Сообщение13.02.2013, 20:08 
Добрый день

Решил установить R и посмотреть, что он умеет.
Возникла сразу проблема: редкие пакеты устанавливаются без ошибок.

Для примера возьмём пакет Cairo (рус. описание http://r-language.ru/articles/cairo)
Написано: install.packages("Cairo")
У меня происходит загрузка пакета, какие-то проверки, потом большое число вызовов gcc и выход с ошибкой. Приведу конец лога:

(лог)

Код:
xlib-backend.c:34: fatal error: X11/Intrinsic.h: No such file or directory
compilation terminated.
make: *** [xlib-backend.o] Помилка 1
ERROR: compilation failed for package ‘Cairo’
* removing ‘/home/ml/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.11/Cairo’

The downloaded packages are in
    ‘/tmp/RtmpuK9qVo/downloaded_packages’
Warning message:
In install.packages("Cairo") :
  installation of package 'Cairo' had non-zero exit status

 
 
 
 Re: R cran packages
Сообщение13.02.2013, 20:21 
Аватара пользователя
Не стоят заголовочные файлы для xlib, надо поставить пакет, который называется xorg-dev или около того. Наверняка потом надо будет еще ставить -dev пакеты для Gtk2 и cairo.
Какой у Вас дистрибутив Linux? В Debian/Ubuntu есть пакет r-cran-cairodevice, похоже в нем то, что Вам нужно.

 
 
 
 Re: R cran packages
Сообщение13.02.2013, 21:16 
Чудно! Этот пакет установился. Делал через установку xorg-dev.

Можете мне подсказать, какие лучше брать пакеты для манипуляций с графами? Я нашёл описание пакета igraph, но он с ним тоже проблемы: пишет, ему требуется gfortran, а он не может быть установлен, потому что сам требует gcc-4.4-base (= 4.4.4-14ubuntu5), а установлен 4.4.4-14ubuntu5.1. Может, есть другие пакеты, которые безпроблемно поставятся + я не знаком с ними вообще, а Вы, может быть, уже сталкивались.

P.S. у меня Ubuntu 10.10

 
 
 
 Re: R cran packages
Сообщение14.02.2013, 13:20 
Аватара пользователя
Я не рабираюсь в R, я просто знаком с репозиторием Debian, поэтому посоветовать по графам не могу. Ситуация с gfortran/4.4.4-14ubuntu5 и gcc-base/4.4.4-14ubuntu5.1 должна решаться обновлением системы. На Вашем месте я бы вообще обновился с неподдерживаемой версии 10.10 на 12.04 LTS или 12.10

 
 
 [ Сообщений: 4 ] 


Powered by phpBB © 2000, 2002, 2005, 2007 phpBB Group