Данные вопросы построения математической модели(в данном случае передаточной функции(ПФ)) изучает идентификация систем. Если у вас в переходной характеристике(ПХ), построенной по экспериментальным данным(массив), присутствует перерегулирование, то объект описывается ПФ

,
где

-постоянные времени,причем

можно приближенно определить из времени переходного процесса, деленного на число между 4 и 5 и то это будет работать для слабоколебательных процессов,

можно определить из конечного значения переходной характеристики, деленного на значение управляющего сигнала.Если у вас отсутствует перерегулирование, то передаточную функцию можно определить в виде

,
либо

,
где последний отличается от первого изгибом на начальном учас тке временной характеристики.

и

находятся аналогично. Данный метод прост, но неточен. Поэтому существуют методы идентификации как МНК,взвешенный МНК, обобщенный МНК и еще другие его модификации, лучше МНК пока не придумано, если брать за основу квадратичный критерий близости полученной ПХ по ПФ и исходную ПХ.
Советую почитать:
Л.Льюнг. Идентификация систем:теория для пользователя, 1991 г. (must-read для всех специалистов по идентификации).
Д.Гроп. Идентификация систем, 1979 г.
П.Эйкхофф. Основы идентификации, 1980 г.
P.S. Методы МНК, что я назвал относятся к параметрической идентификации и применимы, когда нам известны порядок числителя и знаменателя-иначе получается задача структурной идентификации и тут все завязано на угадай порядок системы, короче какие то интуитивные соображения.