Требований к базовому квадрату особых нет. Путь достаточно тупиковый.
Тогда начну с квадрата опубликованного Сергеем. Кстати мое решение C6N36 один в один такой квадрат. Решение C6N36 нашло 20 человек, надеюсь остальные не посещают этот форум. Правда у Alexu007 всего C6N27, но вроде он принципиально не пользуется чужими решениями.

В конце концов исключить Сергея из конкурса, в котором он не принимает участие, будет трудно.
Заполним последние 6 строк и колонок как показано на рисунке. Это будет Г-крюк (по терминологии Картеси) Тогда пространство над Г-крюком будет состоять из матрицы 5х5 где в каждой ячейке будет латинский квадрат 6х6.
Вариантов различных ЛК 6х6 окрашенных в 6 цветов миллион и еще пара. Простейшее решение, для сокращения перебора, ограничить круг используемых ЛК. Например возьмем первый попавшийся ЛК и циклическим сдвигом получим другие ЛК с другой раскраской. Итого получится 6 ЛК. Из них и будем достраивать наш квадрат. Пронумеруем ЛК от 0 до 5. В порядке циклического сдвига. 0 - исходный ЛК.
Получилалась задача:
Дано. Пусть дан квадрат 5x5. Квадрат надо заполнить числами от 0 до 5.
Определение. Прямоугольник вида
AB
CD
, где A,B,C,D числа в вершинах прямоугольника, будем называть запрещенным, если выполняется соотношение:

.
Необходимо заполнить квадрат так, чтобы в нем не было запрещенных прямоугольников.
Решений у этой задачи много. Вот еще одно
Код:
2 1 1 1 1
1 1 2 3 4
1 3 1 4 2
1 2 5 1 3
1 5 4 2 1
Увы этот подход не дает уже решений для C=8,10 и более.
Выход из ситуации видится в увеличении множества базовых ЛК из которых будем строить квадрат. Но как? Ничего умного пока не придумал.