1. Т.е. в приведенном уравнении стоит масса покоя?
Так, поясняю. термины "масса покоя" и "релятивистская масса" не используются. В основном из-за бритвы Оккамы. Как вам может быть известно, когда СТО только создавалась, выяснили, что импульс частицы с массой m ней имеет вид

, где

. И чтобы эта формула была больше похоже на формулу классической механики ввели термин "масса покоя" и "релятивистская масса". При этом возникали неудобные моменты, на вроде того, что у движущейся частицы масса в разные стороны была разной, что довольно нелепо. Более того вид уравнения для импульса и для энергии можно вывести из уравнений Лагранжа и там это не требует введение "релятивистской" массы. Так что в современной физике эти термины не используются.
2. Все же откуда берется дельта E при изменении скорости тела?
Из-за ссилы и берётся. У вас есть уравнение для энергии

, если вы возьмёте полный его дифференциал, то

и если система замкнута, и сила консервативна, то dE=0, значит

где
