Пример с двумя встречающимися правыми тройками работает только если оба вектора имеют равную фазу, так всегда рисуют элм волну в популярных да и учебных текстах. Они могут иметь разные фазы! Тогда можно подобрать их так, что волны схлопнутся полностью.
Раз вы это утверждаете, то значит не рисовали картинку. Пример именно для этого и приводился. Для волн, которые полностью гасят при встрече какой-нибудь из векторов, при этом другой вектор увеличивается в два раза.
Решение волнового уравнения

, где

-любая функция.
Ну всё правильно, профиль может быть любым, мы всегда можем использовать Фурье разложение и рассматривать отдельные гармоники.
Можно вообще выбрать две П-образные функции.
Можно.
Как быть? А просто энергию надо честно вычислить.
Ну вот вы сами и ответили на вопрос. Вычислить честно, т.е. учитывая обе формы энергии. Если у вас профиль в какой-то момент становится плоским, это не означает, что энергия волны равна нулю, это значит, что она перешла в другую форму (здесь речь о пакетах, движущихся навстречу друг другу).