Тут, скорее, наоборот. Соизмеримость диагонали квадрата со стороной не противоречила бы тому, что любой геометрический чертеж состоит из "атомных" отрезков, т.е. таких мельчайших отрезков, которые целое число раз укладываются в любом отрезке этого чертежа (все отрезки чертежа кратны ему). Открытие несоизмеримости диагонали со стороной как раз свидетельствовало скорее против атомарности реального мира. А еще скорее вообще ничего о реальном мире не говорило, а указывало просто на свойство идеализированной модели, которое наверняка не имеет отношения к реальному миру.
.
у греков тоже есть разные предположения.
.
-отсутствие несоизмеримости ведет к невозможности построения предметной материи.
-несоизмеримость может вести как к выводу о недостаточной делимости, так и к атомарности. Парадокс Зенона док-во в пользу второго. Иначе бы "не было движения".
.
Аристотель.
[*Как мы говорили, все начинают с удивления, обстоит ли дело таким именно образом, как удивляются, например, загадочным самодвижущимся игрушкам, или солнцеворотам, или несоизмеримости диагонали, ибо всем, кто еще не усмотрен причину, кажется удивительным, если что-то нельзя измерить самой малой мерой. ]
.
https://royallib.com/read/aristotel/metafizika.html#0