Коронавирус

[wrest]

Франция опередила Россию по общему числу выявлений с начала пандемии, и переместилась на 5 место. Россия на 6-м. Расклад по общему количеству летальных исходов в первой десятке, видимо, не поменяется в ближайшие месяцы.

[vicvolf]

В России есть не только "завозные" случаи заражения штаммом коронавируса "омикрон", в регионах уже выявляют его у людей, не покидавших пределы страны, заявил министр здравоохранения РФ Михаил Мурашко.
https://ria.ru/20220106/omikron-1766781187.html

[Dmitriy40]

Прямо здесь не уточнили, но ещё вчера говорили что все выявления у контактных с завозными. Т.е. гулять в массы пока не ушёл. Но счёт уже явно на дни пошёл.

[vicvolf]

Очередная вспышка заболеваемости, вызванная новым штаммом "омикрон", будет протекать в России тяжелее, чем в Европе. Об этом заявили иммунолог, кандидат медицинских наук Николай Крючков и главный профилактолог УрФО, доктор медицинских наук Сергей Токарев. "У нас "омикрон"-волна будет протекать тяжелее, чем в Британии. Узнаем мы это, конечно, не сразу, по избыточной смертности, как обычно у нас происходит. Поэтому сейчас основная задача — поднять темпы вакцинации, ревакцинации и сдержать заболеваемость", — заявил иммунолог.

В Иркутске зафиксировали первые два случая заражения омикрон-штаммом коронавируса. Об этом сообщила пресс-служба правительства области. Как уточняется, штамм "омикрон" был обнаружен у двух детей из разных семей. Взрослые, находившиеся в контакте с ними, сейчас проходят обследование. По словам медиков, болезнь у пациентов протекает легко. Из симптомов врачи называют характерные для коронавируса признаки.

[wrest]

Сегодня сделал третью вакцинацию... На этот раз решил лайтом бустироваться (прошлые два раза "полным" спутником v).

[Pphantom]

GraNiNi, внимательно прочитайте первое сообщение этой темы. "Любительский" новостной сайт надежным источником информации совершенно точно не является.

Замечание за оффтопик, сообщение удалено.

[vicvolf]

Только самые отчаянные оптимисты могли ожидать, что в 2021 году пандемия коронавируса завершится, и этого, к сожалению, не произошло. Однако основные тенденции, которые, вероятно, будут определять постпандемический мир, формируются на наших глазах. “Ъ” собрал самые важные, переломные и решающие события второго года пандемии и спрогнозировал, что ждать на третий, который, не исключают эксперты, может стать определяющим в борьбе с COVID-19.
https://www.kommersant.ru/doc/5154573

[vicvolf]

Доброе утро! Если Вы или Ваши дети простужены, то оставайтесь дома и вызовите врача. Этим Вы внесете свой вклад в предотвращение новой волны короновируса.

Интересная статья о постковиде https://citytraffic.ru/2022/01/10/%D0%B ... %BD%D0%B0/

[wrest]

Доля Москвы в новых выявлениях от всероссийских, которая держалась весь декабрь на уровне 10%, с рождества поднялась до 20% (соответственно - в Москве поднялся $R_t$ до около 1,2 а в России без Москвы он пока меньше единицы). Так же было в августе-сентябре 2021 и в другие предыдущие волны (а именно -- спад доли до 10% по окончании волны и затем подъем на разные высоты -- от 20% до 40% на ходе волны). То есть волна всегда начинается в Москве (что в общем-то объяснимо).

В общем, встречаем новую волну...

[GraNiNi]

wrest в сообщении #1545711 писал(а):

То есть волна всегда начинается в Москве

Москва - лишь один регион из 85 регионов России, но самый густонаселенный, поэтому по количеству ежедневно инфицированных он забивает многие малые регионы, что и создает такое кажущееся впечатление.

В действительности, одновременно с Москвой и даже раньше, рост начинается и в других регионах.
Так, 7 января, когда Rt для Москвы устойчиво перешагнул рубеж 1,0 уже имелось четыре подобных региона, на следующий день их стало уже 14, а сегодня - 29!
Причем очаги роста географически разбросаны произвольным образом по территории России: от Карелии на севере до Тувы на юге и Камчатского края на востоке.

wrest в сообщении #1545711 писал(а):

встречаем новую волну...

Это еще но волна.
Пока не было сообщений о массовом выявлении среди инфицированных нового штамма - омикрона.

В прошлом году, после "нового года" был аналогичный всплеск в регионах, который достиг максимума 17 января а к концу января сошел на нет, точнее - опустился к исходному уровню.
В общем - ждем и надеемся на лучшее.

[wrest]

GraNiNi в сообщении #1545756 писал(а):

Москва - лишь один регион из 85 регионов России, но самый густонаселенный, поэтому по количеству ежедневно инфицированных он забивает многие малые регионы, что и создает такое кажущееся впечатление.

Я писал не про количество, а про долю этого количества. Возможно вы правы, и ваш показатель "количество регионов где $R_t$ больше единицы, тоже хороший индикатор.

GraNiNi в сообщении #1545756 писал(а):

Пока не было сообщений о выявлении среди инфицированных нового штамма - омикрона.

Этого и не надо... Ясно и так что никуда мы от него не денемся.

GraNiNi в сообщении #1545756 писал(а):

В прошлом году, после "нового года" был аналогичный всплеск в регионах, который достиг максимума 17 января а к концу января сошел на нет, точнее - опустился к исходному уровню.

Да, это так. Очевидно были издержки с логистикой сбора данных. Но заметного подъема именно доли Москвы не было.

GraNiNi в сообщении #1545756 писал(а):

В общем - ждем и надеемся на лучшее.

Тут вопрос что значит "лучшее"... В Нью-Йорке (штате) максимум суточного выявления новых из прошлых лет (ок. 20 тыс. год назад в январе 2021) превышен более чем в 4 раза (сейчас ок. 85 тыс.).
Московский асб. максимум наблюдался в июне 2021 и был 9120. Сейчас около 3 тыс. так что ожидаю роста до 35 тыс. по Москве... "Лучшее" тут будет например только 2-кратное превышение, но и это в 5-6 раз больше от сегодняшних значений.

[EUgeneUS]

GraNiNi в сообщении #1545756 писал(а):

Пока не было сообщений о массовом выявлении среди инфицированных нового штамма - омикрона.

Выявление конкретного штамма - это не ПЦР, который в каждой коммерческой лаборатории делается. Это несколько сложнее. Подозреваю, что требуется полное секвенирование изолята.
А значит это делается только выборочно.

[GraNiNi]

wrest в сообщении #1545759 писал(а):

Тут вопрос что значит "лучшее".

Под "лучшим" я имел ввиду то, что наблюдаемый всплеск заболеваемости обусловлен не о-микроном, а является следствием повышенной новогодней миграции населения со старыми штаммами.

Как уже неоднократно было показано, в России количество официально инфицированных в 2-3 раза меньше их реального количества. Но это не мешает следить за динамикой развития эпидемии, если процент тестирований примерно на одном уровне.

Но здесь может вмешаться энтузиазм чиновников, ожидающих о-микрон, которые, с испугу, резко увеличат количество тестов у населения. А это приведет, в первую очередь, к росту выявляемости обычных штаммов (дельта), которые отличить от о-микрона можно только секвенированием, что не так просто, особенно в периферийных регионах.

-- Пн янв 10, 2022 17:58:16 --

EUgeneUS в сообщении #1545764 писал(а):

Подозреваю, что требуется полное секвенирование изолята.

Я тоже об этом подозреваю.

[Dmitriy40]

EUgeneUS в сообщении #1545764 писал(а):

Подозреваю, что требуется полное секвенирование изолята.

Для полной уверенности - да. Для более-менее обоснованной есть к счастью и более простые способы: писали что один из тестов почти не реагировал на омикрон, в отличие от всех остальных вариантов ковида, соответственно делали два теста и по несрабатыванию второго отбирали подозреваемых на омикрон. Их потом вероятно (не слышал прямых подтверждений, но это как бы самоочевидно) подтверждали секвенированием, благо проверить несколько сотен подозрительных случаев не проблема (здесь количество секвенированных осенью-зимой геномов для России не превышало тысячи за 2 недели). А не так давно были сообщения о разработке тестов конкретно под омикрон, но дошли ли они до практики я не понял.
Это ни разу не возражение Вам, скорее чуток пояснение, вдруг пропустили инфу.

[Red_Herring]

prof_afv: писал(а):

Ниже мнение специалиста по секвенированию/анализу геномов SARS-CoV-2:

Цитата:

Dr. Tom Peacock, a virologist at Imperial College's Department of Infectious Disease, said: "The Cypriot 'Deltacron' sequences reported by several large media outlets look to be quite clearly contamination - they do not cluster on a phylogenetic tree and have a whole Artic primer sequencing amplicon of Omicron in an otherwise Delta backbone.

Я склоняюсь к тому, что в этом конкретном случае дело обстоит именно так. А в общем контексте, при одновременной масштабной циркуляции нескольких вариантов, вероятность появления жизнеспособных рекомбинантов повышена.

Т.е. скорее всего Делтакрон мираж: Дельта и Омикрон смешались в пробирке.