2014 dxdy logo

Научный форум dxdy

Математика, Физика, Computer Science, Machine Learning, LaTeX, Механика и Техника, Химия,
Биология и Медицина, Экономика и Финансовая Математика, Гуманитарные науки




Начать новую тему Ответить на тему
 
 GAUSIAN энергия атомов.
Сообщение03.08.2018, 21:36 


06/05/16
2
В общем так.
Учился я себе на IT и вдруг поступил в магистратуру на химфак. И обалдел....

Занятий нет. Поэтому сам разбираюсь. И вот делаю лабы я из нета. В каждой из них нужно посчитать энергию молекул фтороводорода. Открываю я файл расчёта и вижу там:
Код:
# opt mp2/6-31g(d,p) geom=connectivity
....
HF
--
Symbolic Z-matrix:
Charge =  0 Multiplicity = 1
F                    -1.625     0.24998  -0.00327
H                    -2.505     0.24998  -0.00327
....
                       Standard orientation:                         
---------------------------------------------------------------------
Center     Atomic      Atomic             Coordinates (Angstroms)
Number     Number       Type             X           Y           Z
---------------------------------------------------------------------
      1          9           0        0.000000    0.000000    0.092135
      2          1           0        0.000000    0.000000   -0.829211
---------------------------------------------------------------------
Rotational constants (GHZ):      0.0000000    622.0633900    622.0633900

**********************************************************************

            Population analysis using the SCF density.

**********************************************************************

Orbital symmetries:
       Occupied  (SG) (SG) (SG) (PI) (PI)
       Virtual   (SG) (SG) (SG) (PI) (PI) (SG) (PI) (PI) (DLTA)
                 (DLTA) (SG) (PI) (PI) (SG) (SG)
The electronic state is 1-SG.
Alpha  occ. eigenvalues --  -26.27787  -1.57764  -0.74132  -0.62669  -0.62669
Alpha virt. eigenvalues --    0.21693   1.02926   1.31986   1.48856   1.48856
Alpha virt. eigenvalues --    1.70725   1.89549   1.89549   2.15733   2.15733
Alpha virt. eigenvalues --    2.84684   3.03587   3.03587   4.01171   4.11647
          Condensed to atoms (all electrons):
               1          2
     1  F    9.118735   0.278507
     2  H    0.278507   0.324251
Mulliken charges:
               1
     1  F   -0.397242
     2  H    0.397242
Sum of Mulliken charges =   0.00000
Mulliken charges with hydrogens summed into heavy atoms:
               1
     1  F    0.000000
Electronic spatial extent (au):  <R**2>=             13.1933
Charge=              0.0000 electrons
Dipole moment (field-independent basis, Debye):
    X=              0.0000    Y=              0.0000    Z=             -1.9799  Tot=              1.9799
Quadrupole moment (field-independent basis, Debye-Ang):
   XX=             -5.3785   YY=             -5.3785   ZZ=             -3.3187
   XY=              0.0000   XZ=              0.0000   YZ=              0.0000
Traceless Quadrupole moment (field-independent basis, Debye-Ang):
   XX=             -0.6866   YY=             -0.6866   ZZ=              1.3732
   XY=              0.0000   XZ=              0.0000   YZ=              0.0000
Octapole moment (field-independent basis, Debye-Ang**2):
  XXX=              0.0000  YYY=              0.0000  ZZZ=             -1.9188  XYY=              0.0000
  XXY=              0.0000  XXZ=             -0.1532  XZZ=              0.0000  YZZ=              0.0000
  YYZ=             -0.1532  XYZ=              0.0000
Hexadecapole moment (field-independent basis, Debye-Ang**3):
XXXX=             -2.8797 YYYY=             -2.8797 ZZZZ=             -2.6619 XXXY=              0.0000
XXXZ=              0.0000 YYYX=              0.0000 YYYZ=              0.0000 ZZZX=              0.0000
ZZZY=              0.0000 XXYY=             -0.9599 XXZZ=             -1.1816 YYZZ=             -1.1816
XXYZ=              0.0000 YYXZ=              0.0000 ZZXY=              0.0000
N-N= 5.169170725626D+00 E-N=-2.504841450534D+02  KE= 9.982389905916D+01
Symmetry A1   KE= 8.716154838411D+01
Symmetry A2   KE= 5.503180776131D-51
Symmetry B1   KE= 6.331175337526D+00
Symmetry B2   KE= 6.331175337526D+00
1|1|UNPC-USER-PC|FOpt|RMP2-FC|6-31G(d,p)|F1H1|USERS|03-Aug-2018|0||# o
pt mp2/6-31g(d,p) geom=connectivity||HF||0,1|F,-1.6043270598,0.2499785
7,-0.0032724|H,-2.5256730802,0.24997857,-0.0032724||Version=IA32W-G09R
evD.01|State=1-SG|HF=-100.0111533|MP2=-100.1946391|RMSD=2.947e-009|RMS
F=4.300e-006|Dipole=-0.7401619,0.,0.|PG=C*V [C*(H1F1)]||@

Я правильно понимаю, что энергия атомов:
Код:
Mulliken charges:
               1
     1  F   -0.397242
     2  H    0.397242



Почему одно +, а другое - - тоже не понятно, но пока ладно. Но почему нужно считать сумму энергий в задании лабораторной вообще не понятно. Ведь для двух атомов всегда нуль выходит. Похоже, что я что-то не то смотрю.
Прошу подсказать где найти энергию атомов в гаусиане.

-- 03.08.2018, 23:11 --

Хватит смотреть!
Давайте отвечать! Кто химик тут я или ВЫ!

 Профиль  
                  
 
 Re: GAUSIAN энергия атомов.
Сообщение04.08.2018, 11:09 


06/05/16
2
Разобрался. Я делал # opt mp2/6-31g(d,p) geom=connectivity
А надо было рассчитать отдельно энергию каждого атома в новом проекте.

 Профиль  
                  
 
 Re: GAUSIAN энергия атомов.
Сообщение04.08.2018, 11:42 
Заслуженный участник
Аватара пользователя


28/04/16
1489
BIG_DATE в сообщении #1330457 писал(а):
Я правильно понимаю, что энергия атомов:

Серьёзно?! Заряд приравнять к энергии? :|
И да, энергии атомов считаются по отдельности. Из расчёта молекулы их не вытащить.

P. S. Если Вы закончили It специальность, то считать Gaussian-ом (с 2мя "s") -- это очень странно. Вместо проприетраного софта для домохозяек могли бы какой-то приличный софт, типа Orca или GAMESS изучать.

P. P. S. То же ITшное образование могло бы помочь Вам найти в Гугле форум, специализированый на квантовой химии. И понять, что активность раздела "Химия" на этом форуме весьма низка.

 Профиль  
                  
Показать сообщения за:  Поле сортировки  
Начать новую тему Ответить на тему  [ Сообщений: 3 ] 

Модераторы: photon, Toucan, Супермодераторы



Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей


Вы не можете начинать темы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете добавлять вложения

Найти:
Powered by phpBB © 2000, 2002, 2005, 2007 phpBB Group