Если Вы никогда не работали в этом приложении, а работали только Word, то и пишите в Word, иначе Вы будете не писать свою диссертацию, а долго и нудно изучать LaTeX
1)
- не приложение
2) Пишите в Word-e, а потом, когда скажут, что надо добавить ссылки на источники, поменять где-то оформление, вставить или выкинуть картинку, переставить разделы - и все это не на трех страничках, а в документе на 100+ страниц с десятками рисунков/таблиц/формул/ссылок, вы, во-первых, проклянёте Word, в котором все поползет и надо будет ручками многократно пролистывать и двигать, во-вторых, не факт, что все ссылки/нумерации останутся корректными.
Интресно, вы
tola, писали в Word-е диссертацию по физ.-мат. наукам?