Потому что вирус гриппа постоянно мутирует, поэтому каждый год новая вакцина. Почему от малярии бросает то в жар, то в холод? Тот же каскад постоянных изменений плазмодия и приспособления иммунитета к нему. А вот некоторые ребята очень консервативны, например, трепонема сифилиса. До сих пор спокойно лечится пенициллином.
Про малярийного плазмодия — не совсем понял. Видимо, это неправда,
если имеются в виду те циклы, которые порядка суток. Эти примерно трёхдневные циклы (бывают и другие длительности циклов, это зависит) существуют из-за цикла развития плазмодиев в организме, от одних стадий жарит, от других нет, а стадии у отдельных плазмодиев синхронизированы.