Или та же теория Дарвина, 
А Вы точно в ПРР(Ф) хотите вот это всё обсуждать? 
В таком случае хотел бы понять, какова последовательность создания теорий? 
Для этого Вы могли бы ознакомиться с трудами Томаса Куна и других философов науки, которые этот процесс, наблюдая за работой в т.ч. физиков, вполне неплохо описали. 
kry тут был бы более полезен, чем любой другой активный участник физического раздела. 
Сами же работники науки (ибо философия - - не наука), заняты самой наукой.
3. По поводу того, что называется теорией, но таковым (как по мне) не является, например взять теорию большого взрыва, почему она является теорией, а не гипотезой? 
Ваше непонимание - - это тоже
пару вариантов развития
?