Я и не говорю, что разницы нет. Но почему-то в одном случае энергия поля «уменьшает» массу, а в другом «прибавляет». В чем же тогда разница между этими примерами? В обоих случаях сильное взаимодействие, в обоих случаях мы имеем дело с определенным уровнем абстракции.
В общем-то в случае с нуклонами в ядре это уже не совсем сильное взаимодействие (хотя оно с ним и связано - хорошей аналогией тут являются вандерваальсовы силы, которые тоже не совсем электростатические, хотя и имеют ту же природу).
Грубо говоря, взаимодействие ведет себя разным образом на разных масштабах. Как следствие, на расстояниях, существенно меньших радиуса конфайнмента, где кварки фактически можно считать невзаимодействующими, система представляет собой набор отдельных кварков и глюонное облако, и масса системы больше, чем масса кварков (в основном "стараниями" глюонного облака). На существенно больших расстояниях (как у нуклонов в ядре) это более-менее обычное притяжение, соответственно, отрицательная потенциальная энергия обеспечивает дефект масс.
Ну а в интересующем Вас случае электроны похожи на нуклоны, но только отталкиваются, а не притягиваются. Какой вывод отсюда должен следовать?