Посмотрите пакет GAMESS для квантово-химических ab initio расчетов. Он может быть получен, в т.ч. в исходыми кодами, с сайта
http://www.msg.ameslab.gov/GAMESS/GAMESS.html. Среди поддерживаемых платформ Linux, Cray, IBM BlueGene.
В целом, цитируемый Вами список содержит не области, в которых без суперкомпьютера вообще делать нечего, а области, в которых
некоторые, особо сложные задачи
эффективно решаются только на суперкомпьютерах.
Например, моделировать гидродинамику месторождений нефти и газа можно и на 2D-моделях на обычных компьютерах, что и делается в большинстве случаев. Но в сложных ситуациях, когда требуются детальные 3D- и 4D-модели, нужны суперкомпьютеры.
Еще пример: при разработке фармацевтических препаратов используются квантово-химические расчеты электронной структуры молекул. Здесь расчет простых молекул занимает минуты на обычных компьютерах. А вот для сложных углеводов из сотен атомов требуются суперкомпьютеры.
