У меня вопрос такой: почему только про

и

оговаривается, что они не должны быть равны ( выделено красным в тексте ) ведь

может не быть наименьшим числом еще и по причине равенства других множителей, например, если

?
Мне кажется, Вы что-то напутали. Согласно тексту,

является наименьшим числом (из тех, для которых, как временно предполагается, имеется более одного варианта факторизации)
по определению, а не в силу того, что какие-то простые делители равны. Так что утверждение "ведь

может не быть наименьшим числом" неверно по определению.
А смысл доказательства в том, что последовательно устанавливаются равенства

,

, и так до конца разложения. Вопрос о том, возможно ли здесь равенство

, в этом доказательстве не рассматривается за ненадобностью. Я понимаю так.