Zai, спасибо за ответ!
Про метод Калмана для определения правой части не слышала никогда, знакома только с калмановской фильтрацией, которую для коррекции измерений применяют.
Задача пока решена мной вот таким образом:
во-первых, взята система уравнений не второго порядка, а первого(то есть со скоростями, и скорости и координаты измеряются). В правые части уравнений было введено некоторое слагаемое, которое характеризует изменение ускорения(справа в уравнениях, по факту, ускорение). Это слагаемое требуется найти.
![\[
\left\{ \begin{gathered}
  \frac{{dv_x }}
{{dt}} = a_x (1 + \alpha _x ) \hfill \\
  \frac{{dv_x }}
{{dt}} = a_y (1 + \alpha _y ) \hfill \\
  \frac{{dv_z }}
{{dt}} = a_z (1 + \alpha _z ) \hfill \\ 
\end{gathered}  \right.
\] \[
\left\{ \begin{gathered}
  \frac{{dv_x }}
{{dt}} = a_x (1 + \alpha _x ) \hfill \\
  \frac{{dv_x }}
{{dt}} = a_y (1 + \alpha _y ) \hfill \\
  \frac{{dv_z }}
{{dt}} = a_z (1 + \alpha _z ) \hfill \\ 
\end{gathered}  \right.
\]](https://dxdy-02.korotkov.co.uk/f/9/7/a/97ad9bab8abbde93230a96b14e462c4a82.png) 
Здесь
![\[
\alpha _x ,\,\alpha _y ,\,\alpha _z 
\] \[
\alpha _x ,\,\alpha _y ,\,\alpha _z 
\]](https://dxdy-03.korotkov.co.uk/f/2/7/0/27049989a8a052dd2e435115aa05a96982.png)
 - искомые величины.
Нахожу я их следующим образом(на примере первого уравнения системы):
вводится вспомогательная функция 
![\[
z_h (t)
\] \[
z_h (t)
\]](https://dxdy-04.korotkov.co.uk/f/f/7/b/f7b3adcca5d1e19b2611cd15e356586482.png)
, 
![\[
z_h (0)\, = \,\tilde v_x (0)
\] \[
z_h (0)\, = \,\tilde v_x (0)
\]](https://dxdy-01.korotkov.co.uk/f/8/a/e/8ae59a0d73fda92cda9658b30573e6f182.png)
, где 
![\[
\tilde v_x (0)
\] \[
\tilde v_x (0)
\]](https://dxdy-04.korotkov.co.uk/f/3/f/d/3fd29bcfdfbf7b7cd7285a4e2703590582.png)
 - наблюдаемое значение 
![\[
v_x 
\] \[
v_x 
\]](https://dxdy-02.korotkov.co.uk/f/9/6/7/9674a9d154829c23d62cb5ec304e7a4c82.png)
 в начальный момент времени.
Искомая величина ищется в виде кусочно-постоянной функции.
Для каждого промежутка времени выполняется две операции:
1. минимизируется функционал для нахождения значения 
![\[
\alpha _x 
\] \[
\alpha _x 
\]](https://dxdy-03.korotkov.co.uk/f/a/2/b/a2b761897401c0876ec1be74bdd5cb9c82.png)
 на этом промежутке:
![\[
t_0 (u)\, = \,2\left\langle {z_h (t_i ) - \tilde v_x (t_i ),a_x \alpha _x } \right\rangle  + \alpha \left\| {\alpha _x } \right\|^2 \,\, \to \inf 
\] \[
t_0 (u)\, = \,2\left\langle {z_h (t_i ) - \tilde v_x (t_i ),a_x \alpha _x } \right\rangle  + \alpha \left\| {\alpha _x } \right\|^2 \,\, \to \inf 
\]](https://dxdy-04.korotkov.co.uk/f/3/7/1/371332abc034984f1a16b48d5f0fae5082.png)
,
здесь 
![\[
\alpha
\] \[
\alpha
\]](https://dxdy-01.korotkov.co.uk/f/0/f/d/0fdaf75e71575217450f962dca58395782.png)
 - параметр метода.
2. находится 
![\[
z_h
\] \[
z_h
\]](https://dxdy-03.korotkov.co.uk/f/a/3/6/a36557ea915f8dceaaf81da8fd95208d82.png)
:

\] \[
z_h (t)\, = \,z_h (0)\, + \,[a_x \alpha _x  + a_x ](t - t_i )
\]](https://dxdy-04.korotkov.co.uk/f/7/f/d/7fd20179bc80e0f99291ff75043a8d8582.png) 
![\[
z_h(t)
\] \[
z_h(t)
\]](https://dxdy-04.korotkov.co.uk/f/7/2/7/7273b373c2c9d704300b2282aa21766b82.png)
 - кусочно-линейная функция.