Когда пишут 

 то считается (это просто соглашение, и вряд ли где-то явно озвученное), что всё это - функция одной независимой переменной 

Если хочется рассмотреть функцию двух переменных 

 то говорят иначе: что есть выражение 

 и при этом дополнительно наложено условие (или выполняется уравнение) 

 Разумеется, в таком случае у нас есть плоскость 

 на которой 

 изображается линией, и от выражения 

 можно взять все три производные: 
 
 
 - и все они будут разные. Они будут соответствовать на плоскости направлениям вдоль одной оси, вдоль другой оси, и вдоль линии 

Но, повторяю, обычно всего этого не подразумевают, а когда надо подразумевать - оговаривают явно, как я сказал (со словами про две переменные и дополнительное связывающее их условие).