Молекулярная эволюция на примере какого-нибудь белка?

[Борис Лейкин]

Я собираюсь найти в интернете где-нибудь такую штуку, как думаете получится?:
пишешь, значит, в поисковике базы данных имя или аминокислотную последовательность какого-нибудь белка, а она тебе выводит картинку этого белка (файл с 3Д координатами), ген кодирующий его, да и ещё хорошо бы эволюционные связи с другими белками.

[Вадим Асадулин.]

Борис Лейкин писал(а):

Я собираюсь найти в интернете где-нибудь такую штуку, как думаете получится?:
пишешь, значит, в поисковике базы данных имя или аминокислотную последовательность какого-нибудь белка, а она тебе выводит картинку этого белка (файл с 3Д координатами), ген кодирующий его, да и ещё хорошо бы эволюционные связи с другими белками.

А потом адрес, фотографию, пол, возраст, где живёт носитель этого белка и его эволюционные связи!

[ИСН]

Серьёзные базы всего этого есть, но во-первых, порознь (3D координаты - одно, гены - другое), а во-вторых, они стоят серьёзных же денег

[Chromocenter]

Борис Лейкин
Так что искать - есть такая штучка - http://www.sanger.ac.uk/Software/Pfam/
Там где search можно ввести последовательность аминокислот и он всё найдёт - если подобные данные есть, конечно.
Ещё можно этим: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ пользоваться, в BLAST (наверху там) если пойти.

Добавлено спустя 1 минуту 43 секунды:

ИСН,
То, что я привёл - бесплатное. Я знаю, платные по анали чипов микроаррей, а среди таких я платных даже и не знаю.[/b]

[Борис Лейкин]

В Википедии нашёл про миозин (это белок, который участвует в мышечных сокращениях, и входит в состав цитоскелета; есть классная статья в соросовском журнале)
Там есть картинка филогенетического дерева всех миозинов и ссылка на статью.
Всего, оказывается, существует около 80 разновидностей миозина, и все они произошли от общего предка. Все миозины состоят из 3-х частей: головки, шейки и хвоста. Анализ аминокислотных последовательностей показал, что изменяется только хвостовая часть.

Интересно было бы найти какой-нибудь белок рецептор и посмотреть, как он может измениться.

Вот ещё интересное: "Биологи проектируют новые ферменты"

[Chromocenter]

Борис Лейкин писал(а):

Интересно было бы найти какой-нибудь белок рецептор и посмотреть, как он может измениться.

Ну так а что - выберите рецептор, наберите его в поиске генов вот здесь: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/, потом из результатов возьмите последовательности этого гена для разных организмов, загоните вот сюда:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
Потом по реззультат по-моему эта же программа может построить филогенетическое дерево. А там и видно будет.