Учет того, что кварки находятся в мезонах в связанных состояниях (т.е. нахождение правильных волновых функций) сложная и не решенная полностью задача
А нужная ли? Лептонные процессы - это слабое взаимодействие, на три порядка отстоящее от сильного, и кварки можно считать в зоне асимптотической свободы. Поправки будут невелики. И возможно, хорошо раскладываться в ряд.