2014 dxdy logo

Научный форум dxdy

Математика, Физика, Computer Science, Machine Learning, LaTeX, Механика и Техника, Химия,
Биология и Медицина, Экономика и Финансовая Математика, Гуманитарные науки




Начать новую тему Ответить на тему
 
 Мат и стат программы для биологов
Сообщение19.01.2011, 12:26 
Аватара пользователя


05/01/10
513
Владивосток
Собственно говоря всё в названии. Кто какие знает и для каких целей использует?

Особенно интересует использование мер сходства, разнообразия и т.п.

 Профиль  
                  
 
 Re: Мат и стат программы для биологов
Сообщение23.01.2011, 08:45 
Аватара пользователя


05/01/10
513
Владивосток
Для затравки дам ссылку на обзор А.Б. Новаковского (где то в Сети был бесплатный аналог): http://elibrary.ru/item.asp?id=11788729

 Профиль  
                  
 
 Re: Мат и стат программы для биологов
Сообщение27.01.2011, 06:35 
Аватара пользователя


23/07/08
401
Новосибирск
R? Например Statistics Using R with Biological Examples

Небольшой цикл статей тут Основной автор первых двух частей цикла как раз биолог.

 Профиль  
                  
 
 Re: Мат и стат программы для биологов
Сообщение27.01.2011, 15:45 
Аватара пользователя


05/01/10
513
Владивосток
Хм... Наверное нет.
1. Должно подразумеваться, что использовать может и не спец. А здесь про сути ЯП, а не готовый продукт. По мне так довольно понятный, но для большинства биологов, которые пожелают заняться обработкой это будет сложно.
2. Как со вводом данных? Зачастую биолог собирает массу данных о видовом составе участков (это обычно Эксель). Вводить все в программу сходу обычно не вариант.
3. Как с совместимостью (я нашел, что есть win-версии)?
4. Сугубо биологических индексов и методов нет я так понимаю? Я вижу классическую статистику.

В чём преимущество например перед той же Statistica?

 Профиль  
                  
 
 Re: Мат и стат программы для биологов
Сообщение27.01.2011, 20:34 
Аватара пользователя


23/07/08
401
Новосибирск
rendall в сообщении #405294 писал(а):
В чём преимущество например перед той же Statistica?
Это разработки примерно одного класса, только R ко всему прочему ещё и свободен (идеологический наследник S).

По поводу конкретных методов сходите на CRAN и поглядите на имеющиеся там модули (зайдите в раздел Packages и просто поищите пакеты в описании которых есть, например, слово biology) — возможно то, что нужно, уже есть и придумывать велосипед не придётся. Я, кстати, не зря намекал, что основной автор цикла Шипунов — это биолог.

И да, графические «морды» к R есть в том числе и платные (например SPSS поддерживает довольно значительное подмножество R, если я правильно помню). Но лучше потратить день и таки разобраться с командной строкой, так как в будущем это вполне может сэкономить месяцы.

P.S. Я как-то слабо воспринимаю как можно заниматься анализом статистических данных в «Экселе». Это либо профанация, либо прекрасный способ растянуть время анализа до бесконечности. Что же касается экспорта данных, то R умеет экспортировать их почти отовсюду.

 Профиль  
                  
 
 Re: Мат и стат программы для биологов
Сообщение28.01.2011, 17:37 
Аватара пользователя


05/01/10
513
Владивосток
Не столько анализ сколько ввод именно в этой системе и возможно первичная обработка. Та же Statistica вполне принимет данные от Экселя.

В остальном спасибо за информацию, пойду вникать...

 Профиль  
                  
 
 Re: Мат и стат программы для биологов
Сообщение28.01.2011, 22:15 


10/11/06
64
Материалы по R А.Шипунова (биофак МГУ)

 Профиль  
                  
Показать сообщения за:  Поле сортировки  
Начать новую тему Ответить на тему  [ Сообщений: 7 ] 

Модераторы: Karan, Toucan, PAV, maxal, Супермодераторы



Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей


Вы не можете начинать темы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете добавлять вложения

Найти:
Powered by phpBB © 2000, 2002, 2005, 2007 phpBB Group