Я написал свою диссертацию в LaTeX, стиль небезызвестный dissert.cls (из dissert.tgz, ссылки под рукой нет).
Автореферат тоже делал в LaTeX, стиль тоже нашёл в интернете. Результатом очень доволен, диссертацию защитил

. ВАК всё пропустил, проблем не было. Если интересны подробности, готов ответить.
Кстати, вот ссылка на автореферат:
BoldenkovEN.pdfЗабавно, на сайте нашего института рефераты вывешиваются официально. В то же время в сети куча жуликоватых контор предлагают автореферат за деньги. И диссертацией также торгуют, хотя это прямое нарушение авторских прав. Была среди списка официальной раздачи текста диссертации контора, созданная специально для этого. Таким образом, официальные правила требуют отдавать оригинал диссертации жуликам.