хорошие книги с методиками исследования бактериальных клеток методами СЭМ, желательно на русском
помню только старые учебники : Уикли Б.
Электронная микроскипия для начинающих переиздавался в 1975 и Гайер Г.
Электронная гистохимия 1974. там все было от фиксации, прижизненного окрашивания и внесения меток до управления остриями-зондами самих электронных микроскопов.