Как я понял, предъявленная Вами имитация фрагмента оглавления — это то, что Вы желаете иметь.
Могу Вас поздравить: в классе extarticle по такой схеме нумеруются section, subsection и subsubsection. С той лишь разницей, что у составного номера subsection тоже есть часть, указывающая на номер текущей section.
Рискну предположить, что Вы, возжелав поиметь «главы» и «части», сильно модифицировали класс extarticle. По-видимому, проблема кроется в соответствующих фрагментах кода, а отнюдь не в тех, что меняют layout страницы
.