Доброго времени суток. Нет ли у кого опыта в расчете переходных состояний с помощью программы GAMESS. Еще их называют промежуточные соединения, в общем, я имею ввиду структуры "на вершине" энергетического барьера реакции.
Моя проблема состоит в том, что там нужно брать по возможности близкие к искомому геометрические конфигурации. Или гарантированно лежащие на пути реакции. Мануал предлагает использовать химическую интуицию, но я не химик, и моя интуиция меня здесь подводит. Есть ли какие-то более надежные способы определения примерной конфигурации переходных состояний?
Еще я знаю про Linear Least Motion path analysis (не знаю, как правильно переводят в литературе), но пока не нашла программу, которая умеет это делать (а MacMolPlt у меня вылетает при попытке провести этот расчет).
|