2014 dxdy logo

Научный форум dxdy

Математика, Физика, Computer Science, Machine Learning, LaTeX, Механика и Техника, Химия,
Биология и Медицина, Экономика и Финансовая Математика, Гуманитарные науки




Начать новую тему Ответить на тему
 
 Действительно ли ИИ сделал открытие в микробиологии?
Сообщение28.03.2025, 15:48 
Аватара пользователя


17/10/22
400
Не знаю в какой раздел лучше, здесь наверное более компетентная аудитория в вопросах биологии. На днях вышла громкая новость, что Google AI co-scientist за несколько дней размышлений предложил гипотезу, которая до этого подтвердилась по итогам 10-летнего исследования группой ученых (результаты которого не были опубликованы). Вот оригинал той работы, а вот опубликованная в 2023 работа, которая в ней упомянута и к которой, по умолчанию, имел доступ ИИ.

Я попросил Gemini 2.5 Pro оценить факт возможного плагиата, и вот что он ответил:
Цитата:
Что было известно из статьи 2023 года (Alqurainy et al.):
Сам факт захвата хвоста: Главное открытие статьи 2023 года — это сам принцип мобилизации cf-PICI. Было показано, что они создают свои капсиды, но для формирования полноценной инфекционной частицы им необходим хвост от фага-помощника. Без этого хвоста они неинфекционны. Экспериментально было продемонстрировано, что это работает (как минимум, с фагами HK106 и HK446 в работе).
Наблюдение о распространении: В статье также отмечалось (и это было известно из геномных данных), что одинаковые или очень похожие cf-PICI встречаются у разных видов бактерий. Это наблюдение требовало объяснения.

Что предложил ИИ и в чем новизна гипотезы (по сравнению с тем, что уже было опубликовано в 2023):
ИИ был дан факт №1 (нужен хвост для мобильности) и наблюдение №2 (находятся у разных видов). Вопрос был: как факт №1 объясняет наблюдение №2?
Гипотеза ИИ сфокусировалась не на самом факте захвата хвоста (это было известно), а на свойствах этого захвата, которые позволяют преодолевать межвидовые барьеры:
Широта взаимодействия (Promiscuity): Ключевая идея ИИ — предположение, что капсиды cf-PICI способны взаимодействовать не просто с одним конкретным типом хвоста фага-помощника, а с широким спектром хвостов от различных фагов, которые инфицируют разные виды бактерий.

Новизна: Статья 2023 года показала, что захват хвоста возможен в принципе. Гипотеза ИИ постулирует, что это взаимодействие неспецифично или гибко, что позволяет "пересаживаться" с хвоста одного фага на хвост другого, даже если эти фаги инфицируют разные виды бактерий. Это напрямую объясняет, как один и тот же cf-PICI может использовать разные "транспортные средства" (хвосты разных фагов) для попадания в разные виды бактерий-хозяев.
Роль адаптерных белков: ИИ также предположил (как один из вариантов для исследования), что эту широту взаимодействия могут обеспечивать специальные адаптерные белки, кодируемые самим cf-PICI. Эти белки могли бы служить универсальным "переходником" между капсидом cf-PICI и разными типами фаговых хвостов.

Новизна: Хотя статья 2023 года идентифицировала гены коннектора в cf-PICI, гипотеза ИИ явно фокусируется на их роли в обеспечении именно широкого спектра взаимодействия как механизме межвидового переноса.

Итог:
Научная новизна гипотезы ИИ (относительно статьи 2023 года) заключается не в том, что cf-PICI используют хвосты фагов (это было уже открыто), а в предположении о механизме, объясняющем их межвидовое распространение:
Именно гибкость и широта взаимодействия капсида cf-PICI с разнообразными хвостами от фагов, инфицирующих разные виды бактерий, позволяет cf-PICI преодолевать видовые барьеры, обычно устанавливаемые специфичностью фаговых хвостов.
Возможное участие специфических адаптерных белков cf-PICI в обеспечении этой гибкости взаимодействия.
Таким образом, ИИ не открыл сам факт захвата хвоста, но предложил конкретный механизм (гибкое/широкое взаимодействие с хвостами), который объясняет ранее необъясненное наблюдение (присутствие идентичных cf-PICI у разных видов) на основе уже известных свойств cf-PICI.

На мой уточняющий вопрос относительно предыдущих его разъяснений (сделанных на английском) он ответил так:
Цитата:
Мои выводы не противоречат друг другу, но подчеркивают разные аспекты:
Первоначальный вывод ("claims... should be tempered"): Этот вывод касался того, можно ли считать гипотезу ИИ фундаментальным открытием самого механизма захвата хвоста, сравнимым с открытием из статьи 2023 года. Ответ — нет. Сам факт, что cf-PICI используют хвосты фагов для мобильности, был уже установлен и опубликован. ИИ не открыл этот базовый биологический процесс de novo (с нуля).
Последующее пояснение ("Научная новизна гипотезы ИИ"): Это пояснение фокусировалось на новизне гипотезы ИИ в контексте ответа на конкретный вопрос: "Как объяснить межвидовое распространение?". Здесь ИИ предложил конкретное свойство (широту/гибкость взаимодействия с хвостами) уже известного механизма (захвата хвоста), которое напрямую объясняет наблюдение (распространение между видами). Эта специфическая гипотеза о том, как работает известный механизм для объяснения конкретного феномена, действительно была новаторской в данном контексте и, по заявлению авторов препринта 2025 года, совпала с их неопубликованными выводами.

Совмещение:
ИИ не открыл базовый механизм (захват хвоста). Это сделали ученые в 2023 году.
ИИ сгенерировал новую, конкретную гипотезу, объясняющую наблюдение (межвидовое распространение), используя уже известный механизм. Эта гипотеза заключалась в том, что захват хвоста должен быть гибким/неспецифичным, позволяя взаимодействовать с разными хвостами.
Эта объяснительная гипотеза была "новой" в том смысле, что она конкретизировала, каким именно свойством должен обладать известный механизм для объяснения феномена, и эта конкретизация не была явно прописана в статье 2023 года (хотя и была сильным логическим следствием).
Сила ИИ проявилась в логическом выводе и синтезе: он связал известный механизм (захват хвоста) с необъясненным наблюдением (межвидовое распространение) и правильно вывел необходимое свойство механизма (широта взаимодействия).

Вывод:
Противоречия нет. Мой первоначальный вывод подчеркивал, что ИИ не сделал фундаментального открытия самого механизма. Последующее пояснение подчеркивало новизну конкретной объяснительной гипотезы, которую ИИ сгенерировал в ответ на поставленный вопрос. Утверждения в препринте 2025 года о том, что ИИ "повторил открытие", все еще требуют осторожной интерпретации ("tempered"): ИИ не провел годы экспериментов, чтобы подтвердить эту гипотезу, а сделал очень точный логический вывод на основе предоставленных данных, который совпал с результатами этих (на тот момент неопубликованных) экспериментов. Это демонстрация мощного логического синтеза, а не открытия базового биологического процесса с нуля.

Кому интересно - предлагаю просмотреть обе статьи и оценить правильность их интерпретации Gemini 2.5 Pro. Вы согласны, что ИИ (Google AI co-scientist) самостоятельно сделал научное открытие?

 Профиль  
                  
Показать сообщения за:  Поле сортировки  
Начать новую тему Ответить на тему  [ 1 сообщение ] 

Модераторы: photon, Deggial, korona, Ende, Супермодераторы



Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей


Вы не можете начинать темы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете добавлять вложения

Найти:
Powered by phpBB © 2000, 2002, 2005, 2007 phpBB Group