2014 dxdy logo

Научный форум dxdy

Математика, Физика, Computer Science, Machine Learning, LaTeX, Механика и Техника, Химия,
Биология и Медицина, Экономика и Финансовая Математика, Гуманитарные науки




 
 практическая генетика
Сообщение27.11.2024, 03:16 
(Возможно, тема больше для "биологии и медицины", точно не уверен.)
Как оценивают степень родства по генетическим маркерам (SNP, STR)? Допустим, у меня на руках есть пара геномов и я хочу их сопоставить. Для определённости, пусть это аутосомные геномы. Для определения индекса родства по каждому рассматриваемому локусу надо знать, кроме аллельного состава локуса в сравниваемых геномах, ещё и частоту данных аллелей в популяции. Мои вопросы:
- Где в сети есть базы данных с частотами аутосомных аллелей?
- Как модифицировать подсчёт индекса родства, описанный здесь - https://en.wikipedia.org/wiki/Paternity_Index - для оценки отношений более далёких, чем отцовство?

 
 
 
 Posted automatically
Сообщение27.11.2024, 09:57 
 i  Тема перемещена из форума «Междисциплинарный раздел» в форум «Биология и Медицина»
Причина переноса: тематика.

 
 
 
 Re: практическая генетика
Сообщение06.12.2024, 05:05 
Выяснилось, что имеется вполне фриварный софт - https://familias.no, который удовлетворяет мои хотелки. В дополнение - [url]strider.online[/url] и http://www.ncbi.nlm.nih.gov.

 
 
 [ Сообщений: 3 ] 


Powered by phpBB © 2000, 2002, 2005, 2007 phpBB Group