В начальном сообщении не указано, что находится в векторах. Пусть вектор «комплексных» чисел содержит данные через равные промежутки времени (по всему периоду). Тогда из вектора «времёни» можно получить период. Это и позволит найти частоты и построить график.
В учебном пособии Павлейно М. А., Ромаданов В.М. «Спектральные преобразования в Matlab» (
pdf) (нагуглил за несколько секунд) рассматривается, в частности, вопрос дискретизации сигналов и дискретного преобразования Фурье.