Кроме того, оба ваших способа интерпретации неполноценны.
Школьникам пропорции с нулевыми элементами обычно не встречаются, а потом они встречаются в аналитической геометрии, и студентам нужно отдельно объяснять, что делать с нулями.
что делают химики (и кто еще пишет отношения в таком виде в реальной жизни) - надо спрашивать у них (хотя подозреваю что смеси в которых каждый элемент входит в количестве 0 атомов им не очень интересны).
Моя супруга постоянно такие длинные пропорции применяет. Нулевые элементы у неё не встречаются.