Причем, похоже, что для разных цветов и участков экрана эта поляризация разная.
Это не так, поляризация по всему экрану одинаковая (чтобы не возиться с точным позиционированием плёнок поляризаторов относительно стекла).
Однако поляризация эта зависит от того, под каким углом смотреть на экран. А смотрим мы из одной точки (точнее, двумя глазами - из двух точек).
Считаю это вполне может вызывать описанные ТС эффекты.