появляется подсознательное ожидание звонка
Да, это противно. Сам по помидору не работал, но всё равно представляю, о чём вы.
звуковой сигнал меня раздражает
Варианты:
а) подобрать подходящий, минимально раздражающий звуковой сигнал;
б) пользоваться браслетом, который вам провибрирует на запястье / на лодыжке. Понимаю, что это доп. расходы, но я слышал положительные отзывы от лично знакомых мне людей, которые утверждали, что эти модные в наше время браслеты — фитнес-трекеры — хороши в том числе тем, что вибрирующий будильник гораздо приятнее и эффективнее для побудки и прочих сигналов, чем верещащий или пусть даже вибрирующий телефон.
Помидорная схема лично меня раздражает. Точнее, меня раздражает сам факт превозношения её как панацеи. На самом деле, нужно выработать какую-то более глубокую эффективную схему, затрагивающую не только временные интервалы.
Предположим вчерновую, так: «Я сделаю перерыв, как только доберусь до энной строчки файла». Понятно, что эти

зависят от файла, от его типа, от темпа работы и вообще я тут снова ничего нового не придумал. Но эти

нужно распределять заранее. А если при достижении этой строчки ваш ум требует продолжения работы, а не отдыха, быстренько записывайте в новое текстовое окно свои идеи, со всеми возм. сокр. и идите курить. Когда вернётесь, вы увидите эти краткие записи и продолжите работу.