Но в данном случае мы брали разность хода когда свет на выходе из клина преобразуется в линейный,а вы говорите что у нас здесь в основном эллиптическая поляризация.
Вы очень неаккуратно формулируете утверждения. Местами на выходе действительно линейная поляризация (в половине этих мест середины искомых темных полос), но по большей части эллиптическая.
Тогда почему на выходе схемы получим полосы?
Параллельные поляризаторы дают максимум пропускания, скрещенные - практически нуль.
(Оффтоп)
На окошке с полуприкрытыми жалюзи тоже наблюдаются светлые и темные полосы. Или можно ваш клин ваксой под зебру раскрасить.