Предполагаю, что в данном вопросе может быть две ветки развития мысли:
1. Сделать зависимость наглядней с помощью изменения внешнего вида графического представления (номограммы и т. д.).
2. Сделать зависимость наглядней с помощью изменения аналитического представления (нормировка и т. д.).
Первый вариант сейчас хорошо развивается науками о данных (это то, о чем говорили Munin и grizzly). И здесь нельзя не согласится с наличием большой творческой составляющей при построении зависимостей.
По моему мнению, во втором варианте могут быть какие-то общие подходы. Пример проблемы: если нам необходимо изобразить величину заданную двумя первыми членами разложения в ряд по степеням малого параметра, причем изменение поправки незначительно, а нулевой член
большая постоянная составляющая. При построении графика "как есть" функциональную зависимость поправки не будет видно на фоне постоянной составляющей. Здесь бы не помешало изменить как-то саму величину.