Sicker, однако, вариантов тьма. Лучше погуглить. Ну например. Свойства ярлыка пробовали смотреть на рабочем столе? Вот у Вас FF или Chrome (любой, где возникают проблемы) - что там написано в строчках "Объект" и "Расположение"? Вот так: "C:\Program Files\Google\Chrome\Application\chrome.exe" - как-то так должно быть. Могут оказаться левые команды, адресные строки, левые расширения (типа .bat) и т.д.
(А скорее всего, оно сидит в реестре, мне кажется. И да, действительно очень не хватает посмотреть руками. :) Процессы поизучайте, что там происходит, нет ли чего подозрительного.)
Пример решения схожей проблемы Обратите внимание, что происходило с ярлыками.
Но естественно, в Вашем случае может быть что-то другое.