Сегодня стал ставить на arXiv препринт -- не процессируется. Не понимает опций у пары пакетов. Неудивительно: у них TL2011!
Добавил новые (из TL2016) эти файлы, все прошло: стайлфайлы в той же директории имеют приоритет и читаются они (потом в texmf пользователя, потом в texmf-local, и лишь потом в distribution). Разумеется, повезло: в пакетах мало файлов (искл. документацию)
Это к тому, как надо делать.
(Оффтоп)
Разумеется, я им напишу и ругнусь.