До поры эта тема перестала быть актуальной для меня: сконвертировал в eps и уложился в лимит.
Inkscape совершенно точно умеет сохранять в EPS, так что то, что Вы делали в нем, надо просто сохранить в этом формате, получится нормальная векторная картинка.
Да, созданные в Inkscape рисунки с прозрачностью нормально сохраняются в eps.
Вы подаете в определенный журнал и я просил инструкции этого журнала, а не "типичные". Замечу, что приведенные инструкции абсолютно нетипичны для математических журналов (а также для многих теорфизических и computer science) где стандартом является LaTeX.
Туда и посылаю. Собственно, другие журналы, куда посылал в прошлые разы, в большинстве своём (за исключением электронного) выдвигали те же по характеру требования.
Кроме того инструкции упоминают возможность аплодировали графики в pdf. Поэтому Вам следует связаться с редакцией. Вполне возможно что инструкции просто забыли обновить.
Да, вместе с любым файлом можно послать pdf-версию. Впрочем, сами рисунки типа pdf подсвечиваются как имеющие неприемлемое разрешение.
В общем, спасибо за участие.